Kostel svatého Jana Nepomuckého na Lineckém předměstí v Českých Budějovicích je římskokatolický kostel. Vystavěn byl v letech 1914-15.

Výstavba kostela byla důsledkem snahy o stavbu nové českobudějovické katedrály. Koncem 19. století byl na popud biskupa Martina Říhy zřízen fond na stavbu, nakonec však na popud biskupa Hůlky došlo v roce 1912 pouze k opravě katedrály sv. Mikuláše a ze zbylých peněz bylo rozhodnuto o stavbě nového kostela na Lineckém předměstí. Stavba započala v roce 1914. Stavbu nepříznivě ovlivnilo válečné období, ať už nedostatkem materiálu nebo nedostatkem pracovních sil. Vysvěcen byl 12. září 1915.
Kostel je postaven v novorománském stylu, půlkruhová apsida má beuronské prvky. Na hlavním oltáři se nachází barokní obraz Apoteóza svatého Jana Nepomuckého, který byl původně v kostele sv. Mikuláše. Jeho autorem byl Franz Anton Maulbertsch. Varhany od firmy Schiffer byly dokončeny v roce 1916.